El Ministerio de Educación Superior (MES) le otorga un reconocimiento especial por el Aniversario 35 de su fundación. El acto tuvo lugar en el Aula Magna de la Universidad de La Habana. La distinción fue entregada por  Miguel Díaz-Canel, titular del MES a Rafael Núñez, funcionario del Departamento de Educación del Comité Central del Partido Comunista de Cuba (CCPCC) para que se la haga llegar al líder histórico de la Revolución, el 15 de Julio de 2011.

La Federación Estudiantil Universitaria (FEU) le entrega el premio Alma Máter con carácter excepcional, por su contribución a la formación de las nuevas generaciones y como muestra de la decisión de los estudiantes de continuar la construcción del socialismo, el 18 de noviembre de 2010.
El Instituto Superior Politécnico José Antonio Echeverría (CUJAE) le otorga, en el acto por los 45 años de su fundación, el título de Doctor Honoris Causa, el 2 de diciembre de 2009.
El Instituto Superior Pedagógico Enrique José Varona, en ocasión de su Aniversario 45, le concede el Reconocimiento Especial Educador de Generaciones por sus innumerables aportes a la Educación Cubana, paradigma de profesor martiano y marxista, el 3 de julio de 2009.
La Universidad Pública de El Alto (UPEA), ciudad aledaña a la Paz, Bolivia, le otorga el título de Doctor Honoris Causa. El reconocimiento fue entregado durante un acto celebrado en el auditorio de esa casa de estudios superiores, por el rector, Federico Zelada Bilbao, quien destacó la labor realizada por el Comandante en Jefe frente a la nación cubana, 19 de diciembre de 2008.

La Universidad de las Ciencias Informáticas le otorga el primer título de Doctor Honoris Causa y la Condición Hombres del futuro en su categoría de Oro, por ser el fundador de un sueño, una idea y una obra concreta, de una informática revolucionaria y socialista, al servicio de la Patria y la humanidad, porque ha sido siempre, y lo sigue siendo, un maestro excepcional, 19 de julio de 2007.